外科成立于2005年，重點發展小兒外科、女性肛腸外科、妊娠合并外科疾病的診療，以及腋臭、各種創傷、燒傷等外科疾病的診療，為肛腸疾病提供咨詢服務。小兒外科開展小兒疝氣、鞘膜積液、隱睪、尿道下裂、小兒腸套疊、腸梗阻、小兒闌尾炎和新生兒臍膨出等疾病的手術治療。此外，該科還專業治療小兒包莖、包皮過長等與生殖相關的外科疾病。